Quando un tentativo di distruggere il virus cambia il futuro, Cole si ritrova imprigionato nel 2016 con un instabile Jennifer Goines, che può o non può essere la chiave per tornare a casa. Nel frattempo, Jones e Railly devono affrontare le conseguenze della linea temporale modificata e l'ultimo prigioniero della struttura temporale: Ramsey.