Venturi è in tribunale coi colleghi per il processo all'uomo delle bombe. Una giornalista esperta in serial killer, Daria Di Giacomo chiede un'intervista al capitano. Subito dopo il Ris viene coinvolto dalla territoriale sul caso di due guardie giurate ferite durante una rapina in sala corse. Una nuova presenza nella squadra è la giovane ma già bravissima Francesca...

Un dodicenne sparisce davanti alla lussuosa villa di famiglia. A dare l'allarme il fratello più grande mentre nella cittadina si diffonde il sospetto che il responsabile sia il falegname vicino di casa, noto per i suoi comportamenti stravaganti. Testi cerca di difendere l'uomo che, senza alcuna prova, è considerato colpevole. Il capitano sembra precipitare di nuovo nell'incubo dell'uomo delle bombe quando riceve un pacco anonimo..

Venturi e Levi si mettono sulle tracce del misterioso personaggio che ha ucciso una giovane donna facendola morire di inedia. Sul luogo del ritrovamento del cadavere è rinvenuto anche uno scheletro femminile a cui bisogna restituire un'identità. Francesca ha portato al Ris un ragazzo nero che ha la maglietta sporca di sangue e racconta di aver assistito all'assassinio del cugino che doveva ospitarlo in Italia...

Il Ris è convocato per analizzare una strana scena criminis: in un appartamento preso in affitto da un uomo appena uscito di prigione si è consumato un omicidio, ma manca il cadavere. Francesca è coinvolta dai colleghi della territoriale nel suo primo caso all'esterno. Suo padre e Venturi la rimproverano per la sua iniziativa, ma la nuova arrivata sarà sostenuta da Testi...

Il capitano del Ris è assorbito dalla ricerca di Daria, rapita dal serial killer che gli manda inquietanti messaggi in scatole bianche e utilizza un furgone dello stesso colore...De Biase e Testi sono coinvolti dalla territoriale nel ritrovamento del corpo di una ragazza uccisa da una coltellata nella sua camera da letto.

Una giovane coppia scopre sul greto del fiume il cadavere di una bambina scomparsa la sera prima, secondo la denuncia dei genitori e del fratello adolescente... Il Ris impiega ogni energia per la risoluzione del tragico caso, mentre Venturi discute col generale e il pm che non ritengono utile un interrogatorio con l'uomo delle bombe.

Venturi è gravemente ferito dall'esplosione di un ordigno, avvenuta di fronte la casa di Daria. Testi è costretto a prendere il comando del Ris, ma solo fino a quando il capitano non si sarà ristabilito, mentre De Biase e sua figlia indagano sul caso di un ventenne trovato morto dal padre ubriaco...

Martinelli arriva da Messina per stare vicino al capitano che ha subito una delicata operazione. Incontra la sua ex Giorgia Levi e la incoraggia in vista dell'incontro in carcere l'uomo delle bombe. La psicologa è sempre più convinta che l'assassino di Daria sia un imitatore di serial killer. Il resto del Ris si occupa di identificare il corpo di un ragazzo, scoprendo da chi è stato assassinato.

Il capitano viene dimesso dall'ospedale e torna subito in servizio. Chiede al pm Di Maio l'autorizzazione a mettere sotto controllo l'uomo delle bombe, convinto che ci sia un legame fra lui e il serial killer che lo imita. Testi, Francesca e Levi indagano sul suicidio di una studentessa universitaria fuori sede che prima di gettarsi dalla finestra ha subito una violenza carnale...

Una medium si rivolge a Rocchi, perché ha sognato la morte di una sua cliente. Il capitano della territoriale prende per pazza la donna ma è costretto a far scandagliare il lago che questa ha visto nel suo incubo. Intanto Venturi e De Biase sono alla disperata ricerca della prossima vittima del serial killer, una ragazza bionda ripresa in video in un punto imprecisato della città...

Il Ris indaga sul luogo dell'aggressione subita da Francesca da parte del killer che imita l'uomo delle bombe. Anche il misterioso assassino seriale non ha lasciato alcuna traccia. Il resto del reparto indaga sulla morte di un chimico in contatto con la jihad antieuropea, ucciso dal capo di una cellula del terrorismo islamico.

Una donna è sul cornicione del palazzo dove vive: minaccia di buttarsi di sotto se non riesce a parlare subito col capitano del Ris... la signora vuole giustizia per suo figlio che rischia l'ergastolo per l'omicidio della moglie di un potente finanziare. Venturi studia gli atti e decide di chiedere l'autorizzazione a riaprire il caso. De Biase e Francesca lavorano sul caso di un campione di calcio morto negli spogliatoi...

Francesca si risveglia in una stanza sconosciuta. Ricorda l'aggressione subita, il colpo in testa, poi più nulla. La ragazza doveva discutere con lo psicologo del carcere il profilo del serial killer, ma comprende di essere stata rapita proprio da lui: con orrore scopre che non può più muovere le gambe. Intanto al Ris è massimo allarme: tutti si attivano per salvare la figlia di De Biase...

Il generale Tosi presenta al Ris il nuovo arrivato, il tenente Giovanni Rinaldi e solleva De Biase dalle indagini relative alla scomparsa di sua figlia. I due Ris indagano sulla morte di un uomo che è stato torturato e che sembra aver contratto una malattia infettiva durante un viaggio in Africa. E la Morandi rischia a sua volta, per aver effettuato l'autopsia sul corpo dello sconosciuto...

Venturi segue l'ambulanza che trasporta De Biase, ferito in seguito ad una sparatoria col killer, colpito gravemente dal Ris. Il folle criminale è l'unico che conosce il nascondiglio di Francesca ma è in coma. Il capitano attraversa una grave crisi: non solo la mano offesa dalla bomba non gli ha permesso di difendere l'amico, ma un suo errore passato rischia di far morire Francesca...