Uno strano parassita intacca misteriosamente gli organi interni di un agente dell'FBI. L'agente Dunham atterra in Germania per incontrarsi con un uomo imprigionato che le rivela alcuni dettagli inquietanti su una minaccia ancor più grande. Nel frattempo, Peter e Walter cercano di aiutare Olivia con le onde celebrali di un uomo morto, appunto "Mr. Jones".