Wesley compie un esperimento con il quale crea inavvertitamente dei piccoli robot che si insinuano nel computer di bordo, mettendo in pericolo l'equipaggio dell'Enterprise e il lavoro di uno scienziato che dura da una vita.

Data viene inviato per evacuare una colonia umana di proprietà di una razza aliena. Questa, che aveva un accordo con la Federazione, ha deciso di voler abitare sul pianeta e se gli ospiti non lo lasceranno entro breve verranno annientati.

L'Enterprise investiga su un pianeta la cui colonia è stata completamente distrutta e si sono salvati solamente due persone anziane, con le rispettive case in perfette condizioni. Ma quando l'Enterprise viene attaccata, Picard sospetta ci sia un collegamento con i due anziani.

Un team esterno rivela per sbaglio ad una razza aliena meno avanzata che vive su Mintaka III la tecnologia della Federazione, violando in questo modo la Prima Direttiva. Picard, che ora viene venerato come un Dio dagli alieni, deve cercare di correre ai ripari.

Worf e Wesley devono aiutare un ragazzo di 12 anni ad assimilare la morte di sua madre, un'archeologa morta durante una missione su un pianeta deserto. Ma gli sforzi dei due vengono vanificati quando la donna riappare sull'Enterprise.

L'Enterprise sta investigando su una nave spaziale da molti anni abbandonata alla deriva nello spazio, quando si imbatte lei stessa si imbatte in un pericolo dal quale solo La Forge potrà salvarla. Quest'ultimo trova anche qualche cosa di più in una donna olografica.

Geordi è intrappolato su un pianeta ostile con un Romulano paranoico e ferito gravemente. Allo stesso tempo, nell'orbita attorno al pianeta, una nave Romunlana impedisce all'Enterprise di pianificare una missione di recupero.

L'Enterprise ospita le trattative per i diritti su un nuovo tunnel spaziale, appena scoperto, che si trova nel Quadrante Gamma. Uno dei negoziatori coinvolti, Devinoni Ral, è attratto da Deanna Troi, ma egli ha anche un segreto.

L'Enterprise cerca di fare da paciere tra due clan rivali in lotta fra loro da moltissimi anni. Riker e Picard vengono però coinvolti in prima persona nella faida che coinvolge rinnegati, capi tribali e assassini professionisti.

Un Romulano che sembra essere un traditore avverte la Federazione di un possibile imminente attacco dei Romulani che stanno inoltre stabilendo una base segreta nella Zona Neutrale. Tuttavia,Picard e i suoi uomini sono indecisi se credergli o meno.

Un pianeta che ha fatto richiesta per entrare a far parte della Federazione chiede aiuto all'Enterprise per catturare un pericoloso criminale ricercato per la sua reputazione di eccessivamente violento. Tuttavia, Picard sospetta che le azioni del fuggiasco non siano tutte farina del suo sacco.

La dottoressa Crusher viene rapita dai terroristi mentre si trova su un pianeta flagellato da una guerra civile per prestare i soccorsi; con lei c'è anche Picard. I due sono ritenuti responsabili della morte di una figura chiave della rivolta.

Q riappare sull'Enterprise senza i suoi ormai noti poteri e viene inseguito da esseri che aveva torturato nel passato. Sarà Data a salvare Q dai suoi nemici e il super essere reagisce in modo inaspettatamente altruistico.

Riker viene accusato di essere un assassino quando uno scienziato viene ucciso da un'esplosione. Picard cerca di difendere il suo collega e per provarne l'innocenza riproduce gli ultimi eventi della giornata sul ponte ologrammi.

L'Enterprise vive una realtà temporale parallela, nella quale la Federazione è ancora in lotta con i Klingon e Tasha Yar è ancora viva. Nessuno sembra accorgersi che non si tratta della realtà giusta, eccetto Guinan.

Data crea un'androide continuando gli esperimenti del suo creatore. Questo crea ulteriori problemi legali, perché l'androide dalle sembianze femminili che costruisce è considerata a tutti gli effetti sua figlia.

Worf riesce a incontrare nuovamente dopo tanti anni suo fratello, ma l'occasione non è delle migliori: il padre è stato accusato di aver aiutato i Romulani. Insieme i due fratelli si rivolgono all'Alto Consiglio dei Klingon per far revocare le accuse.

Picard viene rapito e sostituito sull'Enterprise da un suo duplicato. Il vero Picard cerca quindi di sfuggire ai suoi rapitori mentre l'equipaggio della nave si chiede se l'ammutinamento sia la giusta reazione al loro strano capitano.

Il capitano Picard è in vacanza su Risa quando incontra due viaggiatori temporali provenienti dal 27emo secolo e che dicono di essere alla ricerca di una potente arma. Il pericoloso intrigo coinvolgerà anche una donna molto affascinante.

L'Enterprise incontra una nave spaziale nella Zona Neutra e rischia di scontrarsi con i Romulani quando cercano di portare l'immensa creatura vivente ad un incontro con un emissario dei Betazoidi. Anche la creatura darà filo da torcere a Picard e ai suoi uomini.

Un nervoso e insicuro ufficiale Barclay mette in pericolo tutto l'equipaggio quando si dimentica dei suoi doveri come ingegnere e trascorre il suo tempo a mettere in pratica le sue fantasie sul ponte ologrammi.

L'equipaggio viene scosso dall'esplosione di una navicella a bordo della quale si trovava anche Data, che viene dato per morto. Inoltre Picard non può svolgere un'indagine approfondita perché la sua nave viene immediatamente affidata a un'altra missione.

Sarek, il padre vulcaniano di Spock, arriva a bordo dell'Enterprise per condurre una trattativa. Tuttavia il suo equilibrio mentale sembra sempre più precario e l'unica soluzione sembra una fusione di menti con il capitano Picard.

Riker e Troi sono in licenza quando vengono inaspettatamente raggiunti da Lwaxana, la madre di Deanna, e successivamente rapiti da un Ferengi perché quest'ultimo è convinto che la donna possa aiutarlo nei suoi affari. Picard escogita un piano per salvare i tre.

La dottoressa Crusher è attratta da un umanoide ferito che ha anche poteri speciali e soffre di acute amnesie e violenti dolori. L'umaniode è inoltre ricercato dal suo governo che lo ritiene un pericoloso criminale.