Sidney e Vaughn vengono inviati in missione dall'APO per rintracciare un'arma biologica di nuova generazione chiamata "ghiaccio 5" e che è in grado di rendere le persone letteralmente ghiacciate. I due scoprono che la sostanza sta per essere venduta a un acquirente a Damasco. Intanto, Nadia chiede a Jack la verità su sua madre, mentre Sidney si chiede se Vaughn sia ancora colpito dalla morte di Lauren.