Sidney e Vaughn parlano a Jack del coinvolgimento di Sloane nella ricerca del padre di Vaughn e del patto fatto da Irina sulla vita di Sidney. Tuttavia si scopre che il colpevole non è il vero Sloane, ma un altro uomo che si spaccia per lui. Sidney cerca di convincere il vero Sloane a rimanere a capo delle operazioni, ma Nadia ha paura che questo possa risvegliare la sua vecchia ossessione per Rambaldi.