Il dottor Jonathan Michael "J.D." Dorian inizia il suo primo giorno da tirocinante all'ospedale Sacro Cuore. J.D. arriva insieme al chirurgo Chris Turk (detto semplicemente Turk), con cui ha stretto l'amicizia ai tempi del college.

Dopo due settimane dall'inizio del tirocinio J.D. sta cominciando a prendere ritmo con il suo lavoro e a prendere qualche confidenza in più con i suoi colleghi, arrivando perfino ad ospitare Elliot a casa sua e di Turk.

La trama della puntata ruota intorno al presunto errore di Turk nell'operare un paziente che è poi passato sotto le cure di J.D. il quale, notati i continui peggioramenti del paziente, pensa subito ad un possibile infezione dovuta alla prima suturazione del suo amico neochirurgo.

J.D. prende in cura un'anziana donna con un'insufficienza renale, Turk segue un ragazzo che deve togliersi un'ernia ed Elliot ha invece una donna affetta da Lupus che è venuta in ospedale dopo un attacco d'asma.

Elliot prende in cura un tredicenne che non è affatto entusiasta del fatto che il padre lo porti a vedere un incontro di wrestling, al contrario sostiene di voler solo vedere i seni di una bella ragazza. J.D. vede che è stato assegnato un cateterismo a un signore ormai deceduto e lo riferisce al dott. Kelso.

Kelso affida a JD un importante membro del consiglio direttivo dell'ospedale per delle analisi: JD finisce a letto con la paziente, per poi scoprire che è l'ex-moglie del dottor Cox. Nel frattempo Turk è alle prese con la madre di Carla.

JD inizia a prendere confidenza con il mestiere: risponde sempre a tutte le domande di Kelso e si sente il re dell'ospedale. Ma un suo amico specializzando, di nome Nick, buono e gentile, inizia a diventare il numero uno a posto suo

Turk e JD salvano un operatore televisivo di fronte alle telecamere, e Kelso convince JD a dargli l'autorizzazione per usare la loro immagine per una pubblicità sulla solidarietà razziale per l'ospedale. Turk tuttavia si sente offeso dalla campagna.