Dopo aver superato l'esame di Capitano, Beckett riceve la sorpresa di una candidatura per il Senato dello Stato. Castle e Beckett si stanno adeguando al cambiamento di carriera di Beckett, quando la chiamata di un personaggio misterioso innesca una catena di eventi esplosiva.

Dopo aver ricevuto una soffiata misteriosa sul suo passato, Beckett si lancia in una fuga per salvarsi la vita, con una squadra di mercenari sulle sue tracce. Mentre Castle indaga sui motivi della fuga di sua moglie, Beckett deve scoprire chi la vuole morta.

Quando uno studente di college viene trovato orribilmente assassinato, Castle deve andare sotto copertura come professore al fine di accedere al mondo della vittima. Tuttavia, lui e Beckett presto scoprono che dietro il divertimento e i giochi di college si nascondono alcuni segreti oscuri dell'università.

Quando l'idolo di Castle, un autore notoriamente solitario, viene ritrovato morto, Castle è determinato a risolvere l'omicidio del suo eroe. Ma quando lui e Beckett scavono più a fondo, scoprono che la verità è ancora più strana della finzione.

Quando un'opera d'arte di inestimabile valore viene rubata e il suo trasportatore assassinato, Castle e Beckett devono lavorare con il testimone chiave per rintracciare il dipinto e scovare l'assassino.

Il detective Slaughter chiede l'aiuto di Castle per risolvere un caso di rapina molto difficile. Ma quando viene trovato un cadavere legato al crimine, Slaughter diventa il sospettato numero uno e Castle deve stabilire se è colpevole o dimostrare la sua innocenza.

Per dare la caccia al brutale assassino di un seduttore disonesto, Castle e Beckett devono indagare sull'elite di New York. Nel frattempo, Castle pensa di sorprendere Beckett per il loro primo anniversario di matrimonio.

Castle e Beckett indagano sull'omicidio di un intrattenitore di nave da crociera, ma presto finiscono intrappolati in mare con l'assassino.

Quando un corpo viene trovato nel teatro dell'ultimo spettacolo di Marta, l'indagine di Castle e Beckett li porta nel mondo inaspettatamente pericoloso di chi canta "a cappella", senza l'accompagnamento musicale.

Castle ottiene finalmente la sua giornata in tribunale, quando prende posizione come testimone chiave di un omicidio di cinque mesi prima. Ma quando improvvisamente si scoprono nuove informazioni, lui e Beckett devono correre contro il tempo per evitare un fallimento della giustizia.

Quando il figlio di un diplomatico russo viene trovato morto, Beckett e Castle si trovano al centro di un pericoloso intrigo internazionale, con Castleche deve trattenere un agente di sicurezza russo che risulta più coinvolto del previsto.

Castle viene catturato e costretto a lavorare con degli sconosciuti per risolvere i rompicapo di uno squilibrato, mentre Beckett e il 12° Distretto devono correre contro il tempo per salvarlo e catturare il killer.

Beckett e il 12° Distretto lavorano al caso dell'omicidio di uno studente inglese. Ma quando la classe della vittima si rifiuta di parlare con la polizia, Castle opera sotto copertura come immigrato francese-canadese e viene a sapere che la vittima stava nascondendo qualcosa.

Castle torna nella città degli angeli in cerca di risposte sul suo passato. Ma le cose prendono una svolta pericolosa quando viene reclutato dalla leggendaria Greatest Detective Society per risolvere un omicidio.

Quando una recluta dell'Accademia del NYPD viene uccisa, Beckett e la squadra tornano al loro vecchio campo di addestramento per le indagini. Nel frattempo, Castle deve fare i conti con una decisione dalle conseguenze importanti sia per lui che per Beckett.

Un indizio sulla scena del delitto di un conducente di un blindato riporta Beckett e Castle a un vecchio caso risolto da Esposito. Ma sorgono complicazioni quando vengono a sapere che Esposito non ha detto tutto sul suo passato con il colpevole.

L'uccisione di un uomo collegato al contrabbando di reliquie turche manda Castle, Beckett e il 12° Distretto alla ricerca di un antichità rubata che si ritiene sia la lampada di Aladino, nella speranza che questa li possa portare all'assassino.

Quando Hayley fa un favore a un vecchio amico, si ritrova implicata in un attacco e un assassinio cyber-terroristico. Ora, Beckett e Castle devono correre contro il tempo per risolvere il caso e cancellare il nome di Hayley dalla lista dei sospettati.

Quando un mite ispettore sopravvive per miracolo a un avvelenamento, può essere un caso fortunato; ma se succede due volte, è un mistero che Castle e Beckett devono risolvere.

Quando un attore di teatro diventato una star del cinema viene misteriosamente ucciso, Castle e Beckett vanno dietro le quinte e scoprono che la stella aveva molto di cui preoccuparsi.

Quando un detenuto fuggito da un ospedale psichiatrico armato di ascia muore all'improvviso nell'ufficio di Castle, le sue indagini con Beckett lo portano a sospettare che la morte della vittima sia opera dell'Anticristo.