Lincoln e Michael sono ancora all'interno dell'hotel, braccati dalla polizia e dalla SWAT perché considerati responsabili dell'omicidio del figlio del Primo Ministro indiano. I due cercano allora di trovare un modo di fuggire, con l'aiuto di Self e Mahone che sono rimasti all'esterno dell'edificio. Nel frattempo, Christina continua le negoziazioni per la vendita di Scylla.