Uno scuolabus scompare durante il suo tradizionale giro mattutino. Ben presto si capisce che a bordo ci sono dei "dirottatori" che vogliono un riscatto e che alzano sempre di più le loro richieste per rilasciare i bambini.

Quando un prete scompare e la squadra dell'FBI viene chiamata a indagare sul caso, Jack è portato a pensare che il prelato possa essere coinvolto in qualche affare sporco piuttosto che la semplice vittima di un crimine.

Una donna che si era recentemente fidanzata scompare proprio durante i festeggiamenti per il suo fidanzamento. Il team di Jack scopre però che nel suo passato ci sono state numerose frodi e inganni e forse anche questa volta il passato della donna potrebbe avere a che fare con la sua scomparsa.

Quando una violinista di quattordici anni scompare nel nulla, Jack e i suoi uomini cercano di seguire le tracce della ragazza e del suo violino. Nel frattempo, Samantha cerca coraggiosamente di recuperare dalla ferita d'arma da fuoco.

Jack deve riuscire a trovare una donna il cui profilo corrisponde a quello di alcune vittime di un caso risalente a 12 anni prima. Egli scopre anche che Graham Spaulding gli sta mettendo sempre più pressione per farlo cadere in errore.

Uno scandalo legato al sesso in una scuola superiore porta ad un omicidio. Jack e il suo team indagano sulla vicenda con lo scopo di fare chiarezza e capire chi è il responsabile e quale è stato il movente.

La squadra investigativa dell'FBI è sospettosa del fatto che i familiari di un ragazzo sudamericano, rapito in pieno giorno, non si siano fatti avanti per cercare di trovarlo. Si sospetta che la famiglia sia una famiglia di immigranti senza permesso di soggiorno.

Un vigile del fuoco scompare dopo essere riuscito a salvare eroicamente due persone da un edificio in fiamme. Nell'incendio, uno dei suoi amici riesce ad essere salvato dalla morte ma è gravemente ferito.

Un medico molto conosciuto, che però oltre al lavoro non aveva molta vita sociale, scompare. Le indagini fanno scoprire che la donna aveva recentemente rotto un fidanzamento e che aveva comprato una pistola per difendersi.

Luke Horton scompare dopo una rimpatriata tra compagni di scuola. Jack e i suoi indagano per riuscire a rintracciare l'uomo e scoprono che Luke stava vivendo una doppia vita, ma che era finalmente pronto a raccontare la verità.

La scomparsa di un paparazzo offre a Jack un'ampia rosa di sospettati. L'uomo in passato aveva scattato delle foto che avevano rivelato l'omosessualità di un attore, la cui vita fu rovinata e che si era poi suicidato. Ora il fotografo aveva deciso di cambiare vita.

La squadra investigativa guidata da Jack è al lavoro per rintracciare un avvocato difensore che si occupa di criminali. Le indagini sulla vita della persona scomparsa portano Jack a pensare che l'uomo soffrisse di schizofrenia.

Il team indaga sulla scomparsa di un motivatore e si trova a fare i conti con una lunga lista di sospettati. Ulteriori approfondimenti rivelano inoltre che l'uomo ha qualche segreto che potrebbe essere collegato alla sua scomparsa.

Quando un'ex-poliziotta, ora diventata cacciatrice di taglie, scompare nel nulla, Jack e i suoi uomini devono indagare più da vicino sulla vita e sul passato della donna e scoprono qualcosa relativo alla corruzione.

Eric Miller sembra il classico ragazzo di 12 anni senza problemi, ma gli indizi trovati sulla scena della scomparsa fanno pensare che potrebbe trattarsi di un rapimento. Poco dopo, il team investigativo scopre di una foto che girava per la scuola e che ritraeva Eric in pose imbarazzanti.

Sono trascorsi ormai quattro anni da quando la diciottenne Jessica Rabb è scomparsa. Ma grazie alla determinazione di Vivian nel voler ritrovare la ragazza emerge una nuova pista che riguarda la vita sessuale della vittima.

Quando un soldato recentemente tornato dall'Iraq sparisce, Jack e Danny scavano da vicino nella vita dell'uomo e scoprono che potrebbe avere qualche segreto che cercava di nascondere e che potrebbe essere collegato alla sua scomparsa.

Un uomo sparisce dopo essersene andato via dal negozio di parrucchiera della moglie per andare a depositare in banca i ricavi del giorno. Poco prima, i due avevano litigato. Intanto, Danny deve cercare di non farsi trascinare di nuovo nella vita da criminale di suo fratello.

I sospetti e le indagini di Jack si concentrano sul ragazzo di una donna scomparsa con la quale conviveva. Successivamente però, si scopre che l'uomo ha un fratello gemello che potrebbe essere coinvolto nella scomparsa della donna.

Sam aiuta Martin a trovare la zia, che è allo stadio terminale della sua malattia e di cui si sono perse le tracce. I due scoprono che la donna stava usando la sua esperienza come infermiera per aiutare altri pazienti a morire.

Un padre, che da anni cerca di dimostrare l'innocenza del figlio che è stato condannato per omicidio, sparisce senza lasciare tracce. Le circostanze costringono Jack a indagare non solo sul padre, ma anche sul caso di omicidio in cui era coinvolto il figlio.

Il team di Jack investiga sulla scomparsa del coach di una squadra di football del college. La stagione non era andata affatto bene per i suoi giocatori, ma le performance erano anche influenzate dalla politica tenuta dal coach.

Una ragazza che era stata adottata si presenta all'FBI con un articolo di giornale per provare la sua tesi, cioè quella di essere stata rapita quando era ancora una bambina. Jack e i suoi cercano quindi di far venire a galla la verità.