Hiro e Ando si ritrovano cinque anni dopo la distruzione di New York. Tutti quelli con poteri straordinari vengono etichettati come terroristi per poi essere registrati, cacciati ed uccisi. I due incontrano le versioni 'oscure' di altri supereroi che si stanno preparando per una chiarificazione con il Presidente (Sylar sotto mentite spoglie). Tra questi ci sono anche Matt, una Claire dai capelli scuri e un uomo di nome Andy, un texano dal cuore d'oro.