Sheldon - che non vuole ammettere di sentire la mancanza di Leonard, ancora in viaggio - trascorre del tempo con Penny e quest'ultima, per evitare di continuare a perdere agli scacchi 3D, decide di condividere con il vicino di casa un suo segreto. Intanto, Raj cerca di superare la rottura con Lucy, mentre Amy e Bernadette sono insieme in un viaggio di lavoro.