Dopo essere stato rilasciato dagli alieni e dopo tre mesi di viaggio, Tom riesce a raggiungere il suo gruppo e la sua famiglia, ma un incidente complica il suo ritorno. Intanto la 2nd Mass continua la sua resistenza contro l'occupazione aliena, mentre Ben si ribella a suo fratello Hal ed il capitano Weaver - insieme a Pope - prende il comando.