Il team ha rintracciato Milos Koras, l'uomo che sembrerebbe responsabile per il tentato omicidio del Dr. Rosen. Milos gestisce le operazioni per conto della Red Flag, un gruppo di estremisti composto da Alphas. Per fermare l'uomo, Gary dovrà sfruttare la sua nuova amicizia con una giovane donna di nome Anna. Intanto, Nina si sente messa da parte mentre Cameron cerca di convincere Rosen a stare attento.