Una missione anti-terrorismo guidata da Samaritan e messa in atto da agenti ISA non va come previsto, e durante un tentativo di rimediare ai propri errori Control viene rapita da Reese e Root, i quali prevedono di torturarla per scoprire dove sia Shaw. Nel frattempo, il bambino che Samaritan usa per comunicare si mette in contatto con il capo dello staff della Casa Bianca, informandolo di essere la causa del crollo del mercato.