Cercando di salvare una giovane psicologa - Caroline Turing - obiettivo dell'HR, Reese si ritrova inseguito dall'FBI con un comando guidato dall'agente Donnelly. Intanto Finch, nel tentativo di aiutare il socio, viene a contatto con Corwin, che lo intima ad eliminare il software, mentre Carter e Fusco scoprono di stare dalla stessa parte.