Finch si insospettisce quando la macchina non fornisce numeri per tre giorni, per poi comunicare sei identità diverse in pericolo, che poi si scopriranno scomparse. Reese sospetta che la macchina voglia comunicare la presenza di un serial killer e le indagini lo porteranno a Long Island, proprio durante una tempesta che si sta per abbattere. Intanto Carter cerca di evitare Beecher.