Dopo il salvataggio, i sopravvissuti all'incidente aereo devono fare i conti con le conseguenze fisiche e morali, sopratutto Cristina. Callie decide di operare Derek assicurandogli un totale recupero, mentre giura alla moglie di non acconsentire all'amputazione della gamba. Intanto Mark teme che il suo miglioramento sia solo un'avvicinarsi della morte e Karev si sente in colpa verso Arizona.