Nel tentativo di salvare Aaron e Cynthia, Miles, Rachel e Charlie si accorgono che qualcuno ha stordito le guardie dei patrioti e che i due sono fuggiti; nel frattempo, Aaron si rende conto della potenza delle nanotecnologie grazie ad un bambino che incontra nella fuga dal dr. Horn. Nel mentre, Tom e Jason sono ancora in compagnia di Roger Allenford in viaggio verso la Casa Bianca.