Hodgins è da otto settimane in riabilitazione per la sua paralisi, costretto a spostarsi vita su una sedia a rotelle, e ha difficoltà ad adattarsi alla sua nuova vita a casa e in laboratorio. Nel frattempo, Brennan e Booth indagano sulla morte di un pubblico ministero con molteplici imputati da casi precedenti che avrebbero avuto ragioni per ucciderla.