L'assistenza di Joe dà i suoi frutti quando il condannato a morte rivela che Strauss potrebbe essersi rifugiato da uno dei suoi tanti discepoli, anche se il prezzo di questa informazione vede Ryan costretto a continue visite in carcere. L'FBI si reca quindi a Beacon, insospettiti da un alto numero di persone scomparse, un luogo in cui l'ex dottore è in attesa dell'arrivo del suo migliore allievo, Theo.