I Watchdogs, una cella terroristica che punta all'eliminazione della "minaccia" aliena, attaccano un edificio dell'ATCU e Mack si trova costretto ad abbandonare i piani fatti col fratello Ruben per assistere il team. Nel frattempo Coulson e Lincoln si mettono sulle tracce dell'ex agente SHIELD a capo del gruppo, mentre Simmons e May cercano di rintracciare Andrew.