Coulson convince Mace a mandare Daisy, Robbie e Yo Yo in avanscoperta nel tentativo di fermare Eli Morrow, quest'ultimo in possesso di un'arma che potrebbe distruggere l'intera città. Nel frattempo AIDA nasconde un terribile segreto sia a Radcliffe che al team dello S.H.I.E.L.D.