Grazie a Pilcher, Ethan scopre la storia di Wayward Pines, il perché della sua nascita ed il passato del suo creatore, e si rende conto di quanto sia importante mantenerne il controllo. Nel frattempo Theresa si chiede cosa nasconda nel lotto 33 della cittdina, mentre Kate e Harold mettono in atto in piano per fuggire con l'aiuto del corriere, Ted.