Dopo aver raccolto le prove sulla scena del crimine, l'assassinio di un agente che lavorava sotto copertura, Calleigh cade in un canale, invalidandole tutte. Dal momento che non se ne salva nemmeno una, il team del CSI è costretto a raccogliere nuove prove. Intanto l'ex ragazzo di Calleigh, un altro agente sotto copertura, si mostra disponibile a collaborare.