La dottoressa Ellen Sanders viene scelta per operare il Presidente degli Stati Uniti, ma non sa che questo cambierà per sempre la sua vita. Un gruppo di uomini armati prende infatti in ostaggio lei e la sua famiglia: a meno che non uccida il Presidente durante l’operazione, i suoi rapitori uccideranno tutti i suoi cari.

Ellen disobbedisce all'ordine di Duncan di uccidere il presidente degli Stati Uniti durante l'intervento chirurgico. Nel frattempo, la famiglia può continuare a vivere "normalmente", ma la banda controlla ogni loro mossa.

Il presidente degli Stati Uniti decide di scegliere un altro chirurgo per la sua operazione, quindi Duncan minaccia Ellen chiedendole di convincerlo a tenerla come chirurgo. Nel frattempo, Ellen incontra il figlio di Duncan.

Ellen e Brian organizzano un tentativo di fuga con i figli per sfuggire al sequestro. Nel frattempo, la moglie di Duncan gli dice che non vuole più sottoporsi a cure per passare del tempo con la sua famiglia.

Ellen deve prendere un'altra decisione fondamentale per la sua incolumità e quella della sua famiglia mentre opera nella propria casa. Intanto, Duncan è in cerca di risposte da Archer.

La sorella di Ellen si presenta a casa sua con l'intenzione di restare per qualche giorno, e Duncan costringe Ellen a mandarla via senza far nascere dei sospetti sulla situazione.

Ellen e Brian si mettono d'accordo per eliminare Duncan e riuscire finalmente a uscire da questa brutta situazione. La donna allora prende contatti con un uomo che potrebbe aiutarla.

Ellen deve decidere se salvare o meno la vita di Duncan, e in seguito ha un confronto con sua moglie. Nel frattempo, il Presidente informa i suoi collaboratori di voler rivelare i dettagli dell'operazione Informazione Totale.

Gli investigatori si avvicinano sempre di più a trovare la verità dietro la cospirazione per uccidere il Presidente. Duncan riceve dunque l'ordine di eliminare qualcuno molto ben connesso al piano.

Dopo che un membro dello staff del Presidente viene assassinato, Ellen cerca di convincere Duncan a lasciar perdere il piano di ucciderlo. Nel frattempo, Ellen trova un possibile donatore.

Duncan chiude l'intera famiglia in una stanza per un giorno mentre lui e la sua squadra vanno a New York per eliminare la squadra di cecchini che vuole attentare alla vita del presidente.

Brian va dalla polizia per dire tutto sulla situazione, ma alla fine decide di non dire la verità dopo che Burton gli mostra delle prove che mostrerebbero la moglie in atteggiamenti ambigui con Duncan.

Ellen dice a Duncan che non ucciderà il Presidente, ma lo aiuterà comunque a ottenere ciò che vuole, se le darà qualcosa in cambio. Nel frattempo, Nina scopre il piano di Duncan e fugge dall'ospedale.

Prima parte del doppio episodio che chiude la stagione. Dopo che Duncan viene a sapere del tradimento di Sandrine, decide di usarla per salvare Nina e Sawyer. Nel frattempo, proprio mentre Ellen si accinge a operare il Presidente, la First Lady ha un duro faccia a faccia con lei.