Le indagini che Mulder e Scully hanno avviato in precedenza con il teorico della cospirazione e ospite di web-tv show Tad O'Malley sembrano aver risvegliato potenti nemici. Intanto, inizia a diffondersi il panico quando le persone in tutto il paese improvvisamente cominciano ad ammalarsi gravemente e Scully deve trovare una cura.