Un tenente della Marina viene ritrovato morto. Gibbs e i suoi inizialmente credono si tratti di un suicidio. Più tardi, quando un robot - un progetto sperimentale estremamente top secret dal nome 'Otto' - inizia ad avere dei malfunzionamenti e mette a rischio la vita di Abby, il team scopre che è stato lui la causa della morte. Ma chi l'avrà sabotato?