Silver comincia a provare rimorso in seguito al rapimento di Bruce e alla sua imminente esecuzione, ma nonostante questo Galavan le assegna una nuova missione. Nel frattempo Gordon si sveglia a casa di Nygma, dove Cobblepot gli propone un'alleanza per sconfiggere il loro comune nemico, mentre Lucius Fox si accorge della scomparsa di Alfred.