E' un appassionato bacio ad aprire le strade dell'amore a Dawson e Joey, Joey non sa ancora se partire o meno, Jen è disperata dalla morte del nonno e cerca l'appoggio di Dawson. Pacey, invece, in città fa un insolito incontro.

Anche se con qualche difficoltà, la relazione tra Dawson e Joey si fa sempre più interessante e questo porta Pacey e Jen a soffrire del loro allontanamento. Mentre il primo non ha più un amico che lo consoli visti i suoi continui insuccessi, Jen, per compensare l'assenza, fa amicizia con Abby Morgan, una ragazza da cui riguardarsi.

Spinta dalla sua nuova amica, Jen è più che mai decisa a riprendersi un posto nel cuore di Dawson e, per questo, trova un modo per sedurlo. Nel frattempo, mentre la situazione della famiglia Leery è sempre più sconcertante, Pacey ed Andie trovano l'occasione per passare un po' di tempo insieme e così conoscersi meglio.

Dawson e Joey litigano a causa della nuova passione di lei per l'arte:Dawson è indifferente davanti ai dipinti che lei ama tanto. Pacey incontra Tamara e capisce che non prova più gli stessi sentimenti per lei. Jen e Abby vengono ai ferri corti.

Nonostante un forte scetticismo, Joey non riesce in nessun modo a respingere gli influssi provocati dalla luna piena e, per questo, finirà col tradire Dawson che, dal suo canto, deve assistere all'ennesima scenata dei suoi genitori. Le cose non andranno poi bene neppure per Jen ed Abby e per Pacey ed Andie.

Andie convince Dawson, Joey, Pacey, Jen e Jack a partecipare al ballo della scuola, dove cerca di far mettere insieme Jack e Jen. Dawson origlia per caso Joey e Jack che litigano per il loro bacio. Andie passa la serata a cercare di convincere Pacey a ballare...

Dopo la rottura con Joey, Dawson è più che mai deciso a comportarsi in modo vendicativo con l'amica. L'occasione giusta è quando si riunisce con lei e con tutti gli altri a casa di Chris per prepararsi ad un compito. Ma tutti loro sono ben più interessati a discutere dei loro drammi personali.

Il primo film di Dawson vince il primo premio della sessione giovanile al Boston Film Festival e lui euforico vuole dividere trionfo con Joey, che però appare fredda e distaccata. Jack chiede un appuntamento alla giovane Potter che accetta. Pacey si scontra con la tragica realtà di casa McPhee..

E' tempo delle elezioni studentesche ed Andie è decisa a candidarsi insieme a Joey in opposizione ai popolari Abby e Chris che sanno bene come comportarsi in campagna elettorale. Nel frattempo, Dawson è deciso a spendere il denaro vinto nella realizzazione di un nuovo film e si fa aiutare per questo da Jen.

I sentimenti e le emozioni sono messi ad alta tensione quando Dawson e Jen riflettono sulla loro passata relazione mentre Pacey ed Andie decidono di fare un grande passo avventurandosi nel mondo del sesso. Anche Joey ha la sua dose quando accetta di ritrarre Jack nudo per un progetto di artistica

La spregiudicata Abby scopre uno spiegazzato ma sincero biglietto scritto da qualcuno che ha trascorso una notte d'amore e diretto alla persona con cui l'ha passata, e decide di scoprire "i colpevoli", mandando misteriosi inviti per un incontro nell'aula d'inglese a tutti i principali indiziati. Quando Joey, Jack, Dawson, Jen, Pacey e Andy arrivano, fiutano la trappola...

Per l'annuale gara di pesca padre-figlio, Pacey e Dawson devono partire al largo con i loro rispettivi genitori; ma c'è un'ospite sgradito: Jack McPhee. Pacey sa che questa è una delle tante occasioni per essere umiliato dal padre mentre, sulla terra ferma, le ragazze trovano un modo alquanto originale per passare il tempo.

Cominciano i lavori di realizzazione del nuovo film di Dawson e tutti a Capeside ne sono coinvolti. Dawson sa che questo film autobiografico è un pretesto per stare vicino a Joey che, però, non prende positivamente la cosa. Neppure Pacey lo fa quando una sconvolta Andie gli comunica di volerlo lasciare.

Un compito un po' troppo rivelatorio mette Jack in seria difficoltà quando, letto davanti a tutta la classe, questo finisce solo per dichiarare pubblicamente la sua dubbia omosessualità. Ad essere particolarmente vicino al ragazzo è solo Pacey che, proprio per questo, metterà in seria difficoltà la sua situazione scolastica.

Jack, turbato dai pettegolezzi che regnano nella scuola sulla sua omosessualità, rivela la sua vera inclinazione, ammettendo di essere gay. Questo colpo per Joey comporta un riavvicinamento con Dawson. Pacey a scuola dopo la sua sospensione, tiene un discorso davanti al Comitato Direttivo Scolastico, ciò porta al prepensionamento del professor Peterson.

Distrutto dal fatto che Joey voglia restare ancora sola e dalla convinzione che infondo non si sente più maturo dell'anno precedente, Dawson finisce per fare una figura pietosa alla festa del suo compleanno dove si presenta completamente ubriaco insieme ad un'altrettanta spericolata Andie

Alla Fiera Invernale d'Arte di Capeside, Joey scopre da una chiromante l'arrivo di un'inaspettata persona nella sua vita. Lei crede nella possibilità di una nuova cotta, ma ben presto capirà che la donna parlava del padre, uscito per buona condotta dalla prigione in cui era stato rinchiuso.

I Potter, per aumentare gli introiti del ristorante, si occupano del catering per il matrimonio più importante della cittadina. Joey è presa dal panico. Pacey porta Andie al matrimonio. Abby se ne va con Jen ma prima prende una bottiglia di champagne. Sbronze si dirigono sul molo e all'improvviso Abby vola giù nell'acqua gelida..

La morte di Abby scuote tutti: nessuno ammette di sentirsi sollevato dalla sua scomparsa. Jen al funerale si sfoga, denunciando il perbenismo cattolico e l'ipocrisia che aleggia in quella chiesa, nonché ricordando a tutti che Abby era sé stessa, nel bene e nel male. Intanto Dawson cerca di far superare a Joey il trauma dei funerali..

Mentre da una parte Pacey e Jack sono preoccupati per la situazione in cui riversa Andie, dall'altra, si crea una situazione imbarazzante quando Dawson e Joey, per festeggiare il loro primo mese di fidanzamento, scelgono lo stesso ristorante in cui il padre ha un appuntamento con un'altra donna.

Pacey non riesce a riprendersi dal fatto che Andie debba andare in una clinica per i suoi disturbi mentali. Intanto, mentre Jen scappa da casa, Dawson intravede il padre di Joey che accetta sacchetti contenenti cocaina e non sa come dirlo a Joey