Dopo il verificarsi di un tentato omicidio, che ha come obiettivo la piccola star del programma televisivo preferito dal Detective Monk, quest'ultimo decide di accettare l'incarico come sua guardia del corpo.

Mentre si trova ad investigare sullo strano omicidio di una donna ad opera di un killer insolito, Monk fa conoscenza di un vedovo africano che sta cercando di individuare il responsabile della morte di sua moglie.

Monk e Natalie si trovano in una piccola città nel mezzo del deserto quando il detective avvista un UFO. Questo lo porterà ben presto al centro dell'attenzione e ad essere chiamato per investigare sulla morte di una donna trovata nel mezzo del deserto.

Monk deve affrontare una nuova indagine sotto copertura: egli infatti decide di assumere l'identità di un sicario morto per riuscire a scongiurare un complesso piano che ha come obiettivo l'assassinio di una persona.

Le fobie e i mille problemi di Monk potrebbero diventare un punto debole quando il detective viene chiamato in tribunale per testimoniare contro un assassino.

Natalie ha il sospetto che un critico teatrale sia il responsabile di un omicidio. C'è solo un piccolo alibi da smontare: il critico era presente allo spettacolo di sua figlia Julie proprio mentre l'omicidio veniva compiuto.

Monk viene chiamato ad investigare su una serie di strani casi di omicidio, nei quali le vittime, poco prima di morire, ricevono una bambola vodoo. Inoltre, la prossima vittima annunciata sembra essere proprio Natalie.

Il Detective Monk viene costretto a seguire le terapie di gruppo tenute dal suo psicoanalista, il Dottor Bell. Presto però egli inizia a sospettare che tra i pazienti del terapista vi sia anche un omicida che prende di mira gli altri partecipanti alle sedute.

Natalie cerca di organizzare una festa a sorpresa per il compleanno di Monk che, notoriamente, odia le sorprese e che, nel frattempo, è impegnato a cercare di risolvere il caso di omicidio di un uomo che si occupava di fare manutenzioni.

Sharona torna a San Francisco perché deve sbrigare alcune faccende legali legate alla morte di suo zio. Monk teme però che sotto ci sia qualcosa di più e decide di aiutare la sua vecchia amica, dovendo però fare i conti con le differenze di metodo tra lei e Natalie.

Il Detective Monk si mette sulle tracce di una donna che il Dipartimento di Polizia si augura sia solamente scomparsa e non abbia fatto una brutta fine. Durante le sue indagini decide di portare con sé il cane della donna.

Nel tentativo di essere reintegrato nella Polizia, Monk accetta di andare in campeggio con il figlio problematico di uno dei membri della commissione chiamata a giudicare la sua richiesta. Anche lì, però, un omicidio riuscirà a tenere impegnato il detective.

Il capitano Stottlemeyer chiede a Monk di essere il suo testimone di nozze. Tuttavia, prima dalla cerimonia egli si troverà anche a cercare di salvare il matrimonio e, per farlo, deve cercare di capire chi sta cercando di sabotarlo.

Dopo essere stato appena reintegrato nel corpo di Polizia, Monk non vede l'ora di risolvere il suo primo caso. Presto però si rende conto di essere stato assegnato ai compiti amministrativi, anche se pure dal suo posto dietro la scrivania riuscirà a dare un contributo determinante alle indagini.

Monk viene chiamato a investigare su una scena del crimine che è proprio lo stesso luogo in cui ha sentito per la prima volta la notizia dell'uccisione di sua moglie. Da qui comincerà la più importante inchiesta della sua vita.