Inseguendo un giovane ragazzo con pericolosi poteri la dottoressa Helen Magnus incontra Will Zimmerman, uno psichiatra, che potrebbe essere la persona adatta ad aiutarla nella sua disperata missione.

Mentre Will Zimmerman approfondisce la sua conoscenza del mondo in cui la dottoressa Magnus lo ha portato, è costretto ad affrontare le sue vecchie paure. Contemporaneamente in un altro luogo una vecchia conoscenza della dottoressa si avvicina all'obbiettivo a cui stava dando la caccia da molto tempo.

Le origini del misterioso bambino mutante vengono finalmente rivelate, così come la relazione tra Magnus e la sua vecchia fiamma John Druitt. Nel frattempo Ashley va alla ricerca di Ernie Watts, un trafficante d'armi e cacciatore di mostri.

Magnus e Will si confrontano con un determinato John Druitt; il confronto porta a tragiche conseguenze per un membro della squadra. Infine Will deve scegliere tra la sua vecchia vita e la vita al seguito della Dott.ssa Magnus.

Mentre si trovano su un'isola per analizzare una cripta, Magnus e il suo team incontrano delle creature pericoloso e alcune donne dal passato misterioso. Intanto Ashley è determinata nel portare avanti la questione sull'esistenza di suo padre.

L'indagine sulle tre donne ritrovate nella cripta dell'isola sperduta continua e sembra confermare la teoria di Magnus secondo cui sono molto più di ciò che appaiono. Inoltre la ricerca di creature contrabbandate di Ashley produce risultati alterni.

Will cade vittima del sempre più crescente potere delle tre donne, mentre Magnus cerca di rintracciare la loro vera identità grazie a un vecchio personaggio del Sanctuary. Inoltre la sua fortuna nella ricerca di mostri inizia a cambiare...