Lilly torna al suo ultimo caso prima di unirsi alla squadra Cold Case. Si indaga sul brutale triplo omicidio di un ristoratore e della sua famiglia, avvenuto nel 2003.

Lilly e Scott indagano sull'incidente che nel 1943 costò la vita ad Alice Miller.

I detective riaprono un caso di omicidio avvenuto nel 1976. La vittima era una ragazza di 19 anni il cui cadavere non fu mai ritrovato.

Il team di Lilly prende in esame un caso di omicidio avventuto in un carcere nel 1979.

Lilly e John si mettono ad investigare sull'omicidio di una coppia di immigrati colombiani avvenuto nel 1991.

Lilly riapre il caso di una bambina che viene trovata morta in un laghetto.

Un uomo chiede a Lilly e a Scotty di tornare ad investigare sulla morte del suo partner avvenuta nel lontano 1983.

Lilly, su richiesta del figlio della vittima, decide di riaprire il caso di un insegnante simpatizzante del comunismo e coinvolto nella difesa dei diritti civili. Egli era stato assassinato nello stesso giorno in cui i coniugi Rosenberg erano stati uccisi, condannati per aver fornito informazioni all'Unione Sovietica durante la Guerra Fredda.

La macabra scoperta di un gruppo di escursionisti che trovano il corpo di una donna, uccisa nel 1984 nel giorno in cui aveva denunciato il marito per violenza domestica, punta di nuovo le luci sul caso. Le indagini riveleranno che la donna non era stata l'unica vittima...

Il team di Lilly indaga nuovamente sul caso di un procuratore distrettuale portoricano, morto proprio quando nel suo distretto era scomparsa una grande quantità di denaro. La soluzione del caso è importante anche perché un uomo, dopo la morte del procuratore distrettuale, era stato condannato e potrebbe invece essere innocente.

Viene riaperto il caso, all'epoca chiuso come suicidio, di un ragazzo facente parte di una setta morto nel 1978 proprio quando aveva provato a uscirne. Lilly e il suo team scoprono che altri membri della setta possono essere coinvolti.

Un arbitro di pugilato, poco prima di morire, fa una confessione riguardo a un match di molti anni prima a cui aveva partecipato. In quell'occasione un pugile era morto poco dopo l'incontro perché stremato dai colpi dell'avversario, nettamente più bravo di lui.

Il ritrovamento dell'arma di un omicidio avvenuto nel 1987 convince Lilly e Scotty a riaprire il caso di una bambina uccisa da un uomo su un auto. I due detective devono riuscire a risalire al proprietario della macchina.

Il team indaga su un vecchio caso che riguarda la morte di una giovane ragazza, trovata morta nell'appartamento del suo ragazzo, proprio nel giorno in cui questi era scappato in Canada per non dover partire per il Vietnam.

Il team di Lilly riceve un disegno che sembra rappresentare la morte di un ragazzo con problemi mentali. Sebbene si pensasse si fosse trattato di un suicidio, le immagini sembrano suggerire che qualcuno abbia commesso un omicidio.

Stillman apprende dal suo parroco che molti anni prima aveva raccolto la confessione di un uomo che affermava di essere coinvolto nel rapimento di una bambina di 9 anni. Le indagini di Lilly e il suo team porteranno a scoprire una triste storia familiare.

Un uomo cerca di convincere la polizia a riaprire il caso riguardante la morte di sua moglie, di cui lui stesso era stato accusato e per il quale si dichiara innocente. Le indagini vengono effettivamente riaperte da Lilly quando un anello appartenente alla vittima viene ritrovato addosso a un drogato.

Una ragazza dei tempi del liceo di Nick Vera si rivolge alla squadra per indagare sulla morte della sorella alcolizzata, risalente al 1995, sulla quale sospetta ci possa essere il coinvolgimento di una confraternita.

Viene riaperto un caso che riguarda la morte di un giovane ragazzo di colore. Il suo corpo senza vita era stato ritrovato molti anni prima da Will Jeffries, anche se il caso era stato chiuso come irrisolto.

Lilly e il suo team ritornano su un caso di molti anni prima che coinvolge la morte di un giovane operaio. Il motivo della riapertura è l'ammissione da parte di un uomo di aver rubato denaro dal corpo della vittima.

Il team torna a indagare sul passato di un serial killer per impedirgli di uscire di prigione grazie al patteggiamento. Si cerca infatti di incriminarlo per un omicidio avvenuto a Philadelphia molti anni prima. Intanto Scotty apprende che la sua fidanzata è coinvolta in una truffa.

Il fiume Delaware riporta a galla i resti di un cadevere, ricollegato al caso di una ragazza morta nel 1932. Il team di Lilly indaga e pensa che l'omicidio possa essere connesso al fatto che la ragazza avesse una storia con una donna.